所謂“北同仁，南中山”，作為與中大眼科中心分踞南北的頂級眼科專科，同仁醫院眼科中心的水平在北京城內絕對是無出其右。據復旦大學醫院管理研究所頒布的2016年全國眼科專科排行，同仁醫院僅次于中大眼科中心，位列全國第二，平均聲譽值（綜合學科建設、臨床能力、科研成果等方面加權計算得出）比排名第七的北大人民醫院高出3倍，實力無需多言。
作為國家衛計委臨床重點專科、教育部重點學科，同仁眼科設立眼角膜科、眼肌科、眼外傷科等11個亞科，在青光眼、眼底病、眼腫瘤等復雜、疑難眼疾專業中，擁有一批國內頂尖診療團隊，引領國內相關領域的發展方向。
同仁眼底專科擁有國內規模最大的的醫師團隊，在視網膜脫離、病變（特別是糖尿病引發的病變）、眼底腫瘤等復雜眼底病的臨床診治水平處于先進水平，在國內率先開展了間接檢眼鏡下孔源性視網膜脫離的手術治療，最早開展了玻璃體視網膜顯微手術。同仁眼科主任、首席專家魏文彬就是以擅長各種疑難眼底疾病和黃斑疾病而得名，從醫30年間完成復雜性玻璃體視網膜手術10000余例，是國內知名的眼底病專家。相較之下，眼底專科副主任醫師盧海專注于小兒眼底病領域，是國內小兒眼底病權威之一。小兒眼底病發病原因多樣，病情復雜，早期難以發現，在篩查和診療過程中都對醫生綜合能力有較高要求。盧海教授在復雜眼外傷中也有較深造詣，曾在國內率先開展微創玻璃體手術及白內障玻璃體聯合手術。
作為同仁眼科的重點專科，該院青光眼科在臨床診治和科研成果方面得到廣泛認可，是中國醫師協會眼科學分會青光眼委員會主任委員單位。在針對惡性、難治性青光眼的診療技術應用方面，該專業組開創了不少國內的先河。其中有王濤醫師率先使用選擇性激光小梁成型術治療開角型青光眼，科研成果獲2004年全國眼科大會優秀論文獎；唐忻醫師于2010年將微切口玻璃體切除技術和眼內窺鏡應用于青光眼治療中，使得聯合手術治療青光眼更加簡單、且安全有效。一句話來說，臨床與科研相結合，主治面向診治方面的技術研發工作，是同仁青光眼專科保持領先地位的重要原因。
同仁的制鏡歷史可追溯到1906年，從最早的磨鏡室發展成北京其中一個最大的驗光配鏡中心。其派出的代表在2012年“全國首屆驗光配鏡職業技能競賽”斬獲全國驗光組冠軍。同仁的驗光配鏡中心位于東區臨街位置，面積較大，所用鏡片、鏡框均屬上乘品牌，不少達官貴人也在此配鏡，主要面向中高檔市場。
同仁醫院掛號難已經是總所周知，特別在眼科一類的強勢科室更是如此。對于不想早起輪候的朋友，不妨到東區的專家特需門診、門診樓三樓的會診科室，以及夜間門診尋找號源，不過在掛號前請咨詢清楚相關醫生的出診信息，節省時間。
